A Filosofia no Colégio Nossa Senhora da Misericórdia é baseada na Educação na e para a Misericórdia, contribuindo para a formação humano-cristã, dando ênfase à Educação religiosa, observando os valores Evangélicos da Alegria, Acolhimento, Respeito, Solidariedade e Compromisso.

Estes aspectos acontecem através de uma Pastoral Educativa, seguindo o exemplo da Santa Madre Rossello, a primeira educadora da Misericórdia. Esta Misericórdia é elemento essencial para a fraternidade universal e por ela, são criadas e sustentadas as relações mútuas entre as pessoas, no espírito mais profundo de respeito por aquilo que é humano, e pela fraternidade recíproca.